時間の波に飛ばされ、２０６０年から戦国時代へと時空の旅を続けていたスーたちは、激しい戦闘を繰り広げた真田と和睦。さらに、孫兵衛と対馬は、この時代に残り、真田と共に織田と戦うことを選択した。仲間との別離を悲しむ間もなく、時間の津波が到来。スーたちは再び時空を越えた。そして、目の前に現れた新世界は…Ｂ２９が空を飛ぶ、第二次世界大戦末期だった!!さらに、時空を飛ぶ際、間近にスーの弟、トキオがいたという痕跡を発見。スーたちは必死に探すが、姿は見当たらず…!?敗戦へと突き進む不穏な空気の中、スーたちは何を成し、どう生きることを選択するのか…!?